El Museo del IES Canarias Cabrera Pinto está situado en el Instituto de Enseñanza Secundaria de este nombre. Este Instituto se creó en 1846 como centro de Segunda Enseñanza, en la sede de un antiguo convento agustino, en la ciudad de San Cristóbal de La Laguna, en la isla de Tenerife. Fue el primer centro de Enseñanza Secundaria de Canarias, y como todos aquellos centros creados en España por esos años, hemos heredado los materiales de los antiguos Gabinetes de Historia Natural, propios del siglo XIX.
Actualmente seguimos siendo un centro público en el que se imparte la Enseñanza Secundaria y el Bachillerato. El Instituto consta de dos edificios, el antiguo convento y un edificio moderno construido en la parte trasera y separado del primero por una calle pública. En el edificio antiguo se imparte la enseñanza del Bachillerato y se ubica el Museo, además de las dependencias administrativas y despachos del centro, así como la Sala de Profesores. En el edificio moderno se imparte la Enseñanza Secundaria Obligatoria y se encuentran las dependencias deportivas.
Las colecciones del Museo de Historia Natural, el antiguo Gabinete de Historia Natural, forman parte del material educativo del Departamento de Biología y Geología. Y como tal, el profesorado de este Departamento es el encargado de su mantenimiento, uso y cuidado. Ha sido el profesorado de este Departamento el que, a lo largo de los últimos años, ha venido catalogando, restaurando y manteniendo las colecciones, no sólo por su conservación, que lo merece sin duda alguna, sino también porque sigue siendo un excelente recurso didáctico para el alumnado.